Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrx1Q3TL44 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrx1Q3TL44 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms