Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hddc2Q3SXD3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms