Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Arhgap9Q1HDU4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Arhgap9Q1HDU4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arhgap9Q1HDU4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms