Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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