Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

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Length 1,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col19a1Q0VF58 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col19a1Q0VF58 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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