Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne7Q0VE82 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne7Q0VE82 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms