Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ttc21bQ0HA38 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ttc21bQ0HA38 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ttc21bQ0HA38 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc21bQ0HA38 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms