Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnma1Q08460 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms