Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnn2Q08093 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms