Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou6f1Q07916 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou6f1Q07916 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms