Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MestQ07646 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
MestQ07646 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
MestQ07646 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms