Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdx4Q07424 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms