Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Sh3bp2Q06649 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3bp2Q06649 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3bp2Q06649 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3bp2Q06649 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Sh3bp2Q06649 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sh3bp2Q06649 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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