Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms