Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sox9Q04887 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sox9Q04887 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox9Q04887 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox9Q04887 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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