Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms