Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GscQ02591 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GscQ02591 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GscQ02591 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms