Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snai1Q02085 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai1Q02085 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms