Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms