Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EgfrQ01279 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms