Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmgcrQ01237 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms