Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms