Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb2Q00977 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms