Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Serpina1cQ00896 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms