Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms