Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec1P97353 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sec1P97353 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms