Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabpb2P81069 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms