Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Irx1P81068 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Irx1P81068 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Irx1P81068 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Irx1P81068 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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