Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx2P81066 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx2P81066 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx2P81066 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms