Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp9xP70398 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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