Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frat1P70339 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frat1P70339 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms