Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp7P70280 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms