Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf5P70191 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf5P70191 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms