Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg6P61406 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg6P61406 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms