Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms