Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CirbpP60824 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms