Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms