Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Paxbp1P58501 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms