Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdgfP51859 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HdgfP51859 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HdgfP51859 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms