Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LmnaP48678 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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