Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrprbP47758 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms