Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TtlP38585 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TtlP38585 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TtlP38585 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms