Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mmp13P33435 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mmp13P33435 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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