Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc10P31257 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc10P31257 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms