Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DesP31001 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DesP31001 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DesP31001 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DesP31001 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DesP31001 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DesP31001 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DesP31001 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DesP31001 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DesP31001 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms