Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RxraP28700 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RxraP28700 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RxraP28700 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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