Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hoxd10P28359 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hoxd10P28359 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hoxd10P28359 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms