Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa5P28312 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa5P28312 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms