Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
H2afxP27661 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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