Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
U2af2P26369 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
U2af2P26369 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms